小蓝企鹅通常只在夜间活动，而且胆子非常小，小蓝企鹅潜入的海域非常广阔，捕食鱼类、鱿鱼及其他小型的水生动物。小蓝企鹅一般会在黄昏时回到族群喂子，因为它们以小群聚集，可以提供一定的防御，避免掠食者逐一捕捉幼企鹅。小蓝企鹅普遍身高43厘米，体重约为1千克。雄性的体型比雌性的略大一点，而它们的羽毛则没什么大分别。其头部和背部呈靛蓝色，其耳部呈青灰色，到腹部则为白色。其鳍外部为靛蓝色，内部的那一面则呈白色。其深灰黑色的喙长约3至4厘米，脚部朝天的一方为白色，脚底和蹼则呈黑色。未成熟的小蓝企鹅的喙会较短，靛蓝色部分的羽毛也比较浅色。小蓝企鹅的天敌是在巢穴附近虎视眈眈的哺乳类动物：老鼠、短尾鼬、黄鼠狼；成年的小蓝企鹅尚须提防贼鸥及海上的猎食者。野生的小蓝企鹅有时会被新西兰软毛海豹捕食。南澳大利亚研发中心的研究人员作出了相关的研究，发现接近百分之四十的南澳大利亚花岗岩岛海豹的排泄物中有小蓝企鹅肉的成分。