1、线路不同：京九线线路呈南北走向，串联中国华北、华中、华东和华南地区，是国家“八五”计划的第一号工程。京广线，是中国境内一条连接北京市与广州市的国家Ⅰ级客货共线铁路；线路呈南北走向，串联中国华北、华中和华南地区，为中国三横五纵干线铁路网的一纵。

2、起止站点不同：京九线，北起北京西站，南至九龙站（港称红磡站）；京广线，北起北京丰台站，南至广州站。

3、建立时间不同：京九线，1993年京九铁路全线动工建设，于1996年9月1日全线开通运营，全长2407千米（干线路段）。京广线，1957年10月15日，武汉长江大桥建成投入使用，原京汉铁路与粤汉铁路合并成京广铁路，全长2294千米。